潰瘍性結(jié)腸炎(Ulcerative Colitis, UC)作為一種慢性結(jié)腸炎癥性疾病,不僅嚴(yán)重降低患者的生活質(zhì)量,還顯著提高了罹患結(jié)腸癌的風(fēng)險(xiǎn)。巨噬細(xì)胞在UC的發(fā)病進(jìn)程中起著關(guān)鍵作用。丁酸鈉作為腸道微生物發(fā)酵膳食纖維所產(chǎn)生的主要短鏈脂肪酸之一,對(duì)腸道內(nèi)環(huán)境穩(wěn)態(tài)和健康有著不可忽視的影響。基于此,本研究聚焦于丁酸鈉對(duì)巨噬細(xì)胞功能,尤其是巨噬細(xì)胞極化調(diào)控作用的探索。
1. 借助SwissTargetPrediction數(shù)據(jù)庫和表面等離子共振(SPR)技術(shù),精準(zhǔn)識(shí)別丁酸鈉的目標(biāo)靶點(diǎn)蛋白。 2. 運(yùn)用Lip-MS技術(shù)進(jìn)一步深入探究丁酸鈉與其目標(biāo)分子的結(jié)合位點(diǎn),并通過分子對(duì)接、分子動(dòng)力學(xué)模擬細(xì)致解析其結(jié)合模式。 3. 構(gòu)建體外巨噬細(xì)胞極化模型,采用脂多糖(LPS)誘導(dǎo)M1極化,進(jìn)而檢測丁酸鈉對(duì)TGR5(Takeda G蛋白偶聯(lián)受體5)和β-arrestin2表達(dá)水平以及巨噬細(xì)胞極化標(biāo)志物的影響。
1. 明確了TGR5是丁酸鈉的關(guān)鍵目標(biāo)分子,且發(fā)現(xiàn)丁酸鈉與TGR5的氨基酸區(qū)域275 - 286和321 - 330存在潛在結(jié)合位點(diǎn)。 2. 分子對(duì)接分析表明,丁酸鈉與TGR5的ASP - 284和TYR - 287能形成有效的氫鍵相互作用。 3. 細(xì)胞實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,LPS抑制TGR5、β-arrestin2以及M2極化標(biāo)志物的表達(dá),同時(shí)促進(jìn)M1極化標(biāo)志物的表達(dá);而丁酸鈉能夠有效逆轉(zhuǎn)LPS誘導(dǎo)的這些變化。 4. TGR5拮抗劑SBI - 115和β-arrestin2基因敲低會(huì)抑制丁酸鈉的作用效果,而TGR5激動(dòng)劑INT - 777則能夠逆轉(zhuǎn)β-arrestin2敲低對(duì)丁酸鈉作用的抑制。
1. 丁酸鈉可通過TGR5/β-arrestin2信號(hào)途徑抑制LPS誘導(dǎo)的M1樣極化,同時(shí)促進(jìn)M2樣極化。 2. TGR5被證實(shí)為丁酸鈉的直接作用靶點(diǎn),且GPBAR1[275 - 286]是丁酸鈉在TGR5上的特異性結(jié)合位點(diǎn)。
SPR方法描述:
研錦生物可以利用基于靶點(diǎn)或小分子結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計(jì)方法,對(duì)可購買化合物、天然產(chǎn)物等數(shù)據(jù)庫進(jìn)行虛擬篩選,并獲得潛在活性的化合物列表供進(jìn)一步活性實(shí)驗(yàn)確證。面向制藥企業(yè)和科研院所,可提供一站式的早期藥物研發(fā)服務(wù),包括虛擬藥物篩選、先導(dǎo)優(yōu)化、靶標(biāo)預(yù)測、 動(dòng)力學(xué)模擬等,涉及小分子化學(xué)藥、生物藥、中藥等多種新藥類型,為您提供優(yōu)質(zhì)的藥物發(fā)現(xiàn)服務(wù)
Yangenebio對(duì)于中藥及小分子藥物研究,建立了一套完整的技術(shù)服務(wù)體系: 武漢研錦生物科技有限公司(YanGeneBio)提供產(chǎn)品: 1,天然產(chǎn)物、中藥、代謝物等化合物靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)及SPR親和力驗(yàn)證解決方案: 1)中藥/復(fù)方的有效成分高精度鑒定,網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析及SPR驗(yàn)證互作; 2)化合物釣靶(標(biāo)記法):ABPP釣靶(特異性強(qiáng),重復(fù)性高,細(xì)胞水平釣靶); 3)化合物釣靶(非標(biāo)記法):Lip-MS/CETSA(細(xì)胞、組織裂解液水平釣靶); 4)SPR/MST/BLI/ITC/DSF等策略檢測分子間親和力; 5)藥﹣靶結(jié)合位點(diǎn)分析(Lip-MS+分子對(duì)接鑒定純蛋白與化合物互作位點(diǎn)); 6)蛋白-蛋白結(jié)合位點(diǎn)分析(交聯(lián)質(zhì)譜+分子對(duì)接鑒定2個(gè)純蛋白間互作位點(diǎn)); 7)ABPP-WB/CETSA-WB 在細(xì)胞水平鑒定藥物與靶點(diǎn)蛋白互作分析; 8)提供真核、原核蛋白表達(dá)純化服務(wù); 9)提供定制化基因敲除細(xì)胞模型驗(yàn)證藥物活性; 10)基于分子對(duì)接等策略提供化合物高通量虛擬篩選技術(shù)服務(wù); 11)提供蛋白、抗體芯片篩選服務(wù):磷酸化抗體芯片,炎癥因子蛋白芯片等檢測服務(wù); 12)提供Olink多因子蛋白組學(xué)檢測服務(wù)。 2,提供重組活性細(xì)胞因子產(chǎn)品:應(yīng)用類器官培養(yǎng)、完全培養(yǎng)基添加劑、干細(xì)胞培養(yǎng)、細(xì)胞治療等領(lǐng)域。 3,提供分子互作儀、細(xì)胞電轉(zhuǎn)儀、蛋白純化儀、核酸合成儀及純化儀等設(shè)備。